Безопасность пользователей является главным приоритетом для администрации анонимных торговых площадок. Проект mega darknet внедрил несколько уровней защиты аккаунтов. В частности, всем пользователям настоятельно рекомендуется активировать двухфакторную аутентификацию (2FA) через PGP-ключ. Это не позволяет злоумышленникам получить доступ к учетной записи, даже если им удастся завладеть логином и паролем. Все важные коммуникации также шифруются.